Menurut PP No. 153 Tahun 2000, Senat Fakultas merupakan badan normatif dan perwakilan tertinggi di lingkungan fakultas yang memiliki wewenang untuk menjabarkan kebijakan dan peraturan universitas untuk fakultas yang bersangkutan.
Senat Fakultas Teknologi Pertanian periode tahun 2016 – 2021 dikukuhkan dengan Surat Keputusan Rektor Universitas Gadjah Mada No. 628/UNI.P/SK/HUKOR/2016 tanggal 26 Mei 2016. Adapaun susunan pimpinan Senat Fakultas Teknologi Pertanian adalah :
KETUA : Prof. Dr. Ir. Sutardi, M.App.Sc.
SEKRETARIS : Dr. Ir. Makhmudun Ainuri, M.Si.