Departemen merupakan unsur pelaksana akademik pada Fakultas yang melaksanakan pendidikan akademik dan/atau profesional dalam sebagian atau satu cabang ilmu pengetahuan, teknologi, atau kesenian tertentu (PP No. 30 Tahun 1990).
Pengelola Departemen di Fakultas Teknologi Pertanian UGM Periode 2016-2021
- Ketua Departemen TPHP : Dr. Ir. Muhammad Nur Cahyanto, M.Sc.
- Sekretaris Departemen TPHP : Dr. Ria Millati, S.T., M.T.
- Ketua Departemen TPB : Prof. Dr. Ir. Bambang Purwantana, M.Agr.
- Sekretaris Departemen TPB : Dr. Murtiningrum, STP, M.Eng. (2017-2021)
- Ketua Departemen TIP : Dr. Ir. Adi Djoko Guritno, MSIE
- Sekretaris Departemen TIP : Dr. Nafis Khuriyati, STP, M.Agr.