Tugas-tugas administrasi Fakultas Teknologi Pertanian dilaksanakan oleh bagian administrasi yang diketuai oleh Kepala Kantor yang dibantu oleh dua Koordinator Bidang yaitu (1) Bidang Akademik dan Kemahasiswaan dan (2) Bidang Administrasi Keuangan dan Umum. Masing-masing seksi dibantu oleh beberapa tenaga pelaksana.
Kepala Kantor Administrasi : Agung Wijayanto, S.E, M.Acc.
Ketua Tim Kerja Akademik dan Kemahasiswaan : Nur Cahyati Wahyuni, S.Ant, M.Sc.
Ketua Tim Kerja Administrasi, Keuangan, dan Umum : Indira Fauzia Basrawy, S.Sos., M.B.A.