Tugas-tugas administrasi Fakultas Teknologi Pertanian dilaksanakan oleh bagian administrasi yang diketuai oleh Kepala Kantor yang dibantu oleh dua Kepala Seksi yaitu (1) Seksi Akademik dan Kemahasiswaan dan (2) Seksi Administrasi Keuangan dan Umum. Masing-masing seksi dibantu oleh beberapa tenaga pelaksana.
Kepala Kantor : Agung Wijayanto, SE, M.Acc.
Kepala Seksi Akademik dan Kemahasiswaan : Nur Cahyati Wahyuni, S.Ant, M.Sc.
Kepala Seksi Administrasi, Keuangan dan Umum : Indira Fauzia Basrawy, S.Sos., M.B.A.