Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) berdiri pada tahun 1994 merupakan satu-satunya badan akreditasi yang diakui oleh pemerintah Republik Indonesia (dalam hal ini oleh Kementerian Riset Teknologi Dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia). BAN-PT merupakan lembaga yang mempunyai fungsi penilaian mutu perguruan tinggi, meliputi Perguruan Tinggi Negeri dan Swasta.
Berikut adalah hasil akreditasi yang telah dilakukan oleh BAN-PT terhadap program studi yang ada di Fakultas Teknologi Pertanian Universitas Gadjah Mada:
| No | Jenjang | Prodi | No. SK | Berlaku s/d | Peringkat |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Sarjana (S1) | Teknologi Pangan dan Hasil Pertanian | 109/SK/BAN-PT/Akred/S/IV/2014 | 2019-04-25 | A |
| 2 | Sarjana (S1) | Teknik Pertanian dan Biosistem | 109/SK/BAN-PT/Akred/S/IV/2014 | 2019-04-25 | A |
| 3 | Sarjana (S1) | Teknologi Industri Pertanian | 119/SK/BAN-PT/Akred/S/V/2014 | 2019-05-02 | A |
| 4 | Magister (S2) | Ilmu dan Teknologi Pangan | 0541/SK/BAN-PT/Akred/M/V/2016 | 2021-05-20 | A |
| 5 | Magister (S2) | Teknologi Hasil Perkebunan | 421/SK/BAN-PT/Akred/M/X/2014 | 2019-10-23 | A |
| 6 | Magister (S2) | Teknik Pertanian | 463/SK/BAN-PT/Akred/M/XII/2014 | 2019-12-07 | A |
| 7 | Magister (S2) | Teknologi Industri Pertanian | 0031/SK/BAN-PT/Akred/M/I/2016 | 2021-01-21 | A |
| 8 | Doktor (S3) | Ilmu Pangan | 0225/SK/BAN-PT/Akred/D/IV/2016 | 2021-04-15 | A |
| 9 | Doktor (S3) | Ilmu Teknik Pertanian | 0224/SK/BAN-PT/Akred/D/IV/2016 | 2021-04-15 | A |
Sumber: Akreditasi BAN-PT Kementerian Riset Teknologi dan Perguruan Tinggi Republik Indonesia. (https://banpt.or.id/)