Tugas-tugas administrasi Fakultas Teknologi Pertanian dilaksanakan oleh bagian administrasi yang diketuai oleh Kepala Kantor yang dibantu oleh dua Koordinator Bidang yaitu (1) Bidang Akademik dan Kemahasiswaan dan (2) Bidang Administrasi Keuangan dan Umum. Masing-masing seksi dibantu oleh beberapa tenaga pelaksana.
Kepala Kantor : Agung Wijayanto, S.E, M.Acc.
Koordinator Bidang Akademik dan Kemahasiswaan : Nur Cahyati Wahyuni, S.Ant, M.Sc.
Koordinator Bidang Administrasi, Keuangan, dan Umum : Indira Fauzia Basrawy, S.Sos., M.B.A.